支气管镜检查可能存在出血、感染、喉痉挛等风险，但整体安全性较高。支气管镜检查的危害主要有黏膜损伤、低氧血症、心律失常、气胸、麻醉相关并发症等。
支气管镜进入气道时可能摩擦黏膜导致出血或水肿，表现为检查后痰中带血。操作时动作轻柔可降低风险，严重出血需用肾上腺素棉球局部止血。长期服用抗凝药物者需提前告知医生。
检查过程中支气管镜占据部分气道空间，可能影响通气功能。血氧饱和度短暂下降常见，通常通过鼻导管吸氧即可缓解。慢性阻塞性肺疾病患者需加强氧疗监测。
器械刺激气管隆突可能引发反射性心动过缓或室性早搏。多数为一过性改变，术前心电图筛查可评估风险。严重心律失常需立即停止操作并静脉注射阿托品。
活检钳穿透胸膜时可导致肺泡破裂，多见于肺边缘病灶取材。患者突发胸痛伴呼吸困难需警惕，胸部X线可确诊。少量气胸可自行吸收，大量气胸需胸腔闭式引流。
局部麻醉可能引起喉头水肿或药物过敏，全身麻醉存在呼吸抑制风险。术前需评估麻醉药物过敏史，配备气管插管设备。咽喉部喷雾利多卡因前需测试过敏反应。
检查前4小时需禁食禁水避免误吸，术后2小时暂禁食直至咽反射恢复。出现持续胸痛、咯鲜血或呼吸困难需立即就医。术后24小时内避免剧烈运动，可适当饮用温凉流食。吸烟者应至少戒烟1周以减少气道刺激，有慢性呼吸系统疾病者需备好急救药物。
