板蓝根具有清热解毒、凉血利咽的功效，主要用于治疗风热感冒、咽喉肿痛、痄腮等疾病。其主要作用包括抗病毒、抗菌、抗炎、调节免疫等。
板蓝根对流感病毒、呼吸道合胞病毒等具有抑制作用。其有效成分如靛玉红可通过干扰病毒复制过程发挥抗病毒作用。临床常用于病毒性感冒早期，可缓解发热头痛症状。风寒感冒患者不宜使用。
板蓝根对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌等致病菌有抑制效果。所含板蓝根多糖能降低炎症因子水平，减轻咽喉黏膜充血肿胀。适用于急性扁桃体炎、口腔溃疡等细菌感染性疾病。
板蓝根性寒味苦，能清除肺胃实热。对于热毒壅盛导致的咽喉肿痛、声音嘶哑有缓解作用。常与连翘、薄荷等配伍使用，如板蓝根颗粒可改善灼热型咽炎患者的吞咽疼痛。
板蓝根多糖能促进淋巴细胞增殖，增强巨噬细胞吞噬能力。在手足口病等病毒感染性疾病中，可通过提高机体免疫力辅助缩短病程。但免疫功能亢进者需谨慎使用。
对痄腮、丹毒等热毒性疾病，板蓝根可配伍黄芩、黄连使用。其提取物能减轻局部组织渗出性水肿，抑制带状疱疹病毒扩散。外用时可用板蓝根煎液湿敷患处。
使用板蓝根制剂时需辨证施治，风寒感冒及脾胃虚寒者忌用。不宜长期连续服用超过7天，避免引起胃肠不适。儿童、孕妇应在医师指导下使用，过敏体质者需警惕皮疹等不良反应。日常预防感冒可短期适量服用，出现高热不退或化脓性扁桃体炎应及时就医。
