阴茎内部隐痛可能由前列腺炎、尿道炎、精囊炎、泌尿系统结石或神经痛等原因引起，建议及时就医明确诊断。
前列腺炎可能导致阴茎根部或会阴部放射性隐痛，常伴随尿频、尿急症状。可能与久坐、饮酒或细菌感染有关。临床常用盐酸坦索罗辛缓释胶囊、前列舒通胶囊、左氧氟沙星片等药物缓解症状，需配合温水坐浴促进局部炎症消退。
尿道黏膜炎症可引发排尿时阴茎灼热感及间歇性隐痛，常见病原体包括淋球菌或衣原体。可遵医嘱使用头孢克肟分散片、阿奇霉素片、热淋清颗粒等药物，治疗期间需避免性生活并保持每日饮水2000毫升以上。
精囊充血炎症可表现为射精后阴茎深部胀痛，可能伴随血精。与过度性生活或逆行感染相关。医生可能开具癃清片、盐酸环丙沙星片、八正合剂等药物，建议避免骑自行车等压迫会阴部的活动。
输尿管下段或膀胱结石移动时可能刺激阴茎神经产生牵涉痛，多伴有腰部绞痛。可通过金钱草颗粒、排石颗粒等药物辅助排石，严重者需体外冲击波碎石治疗。
阴部神经受压或损伤可能导致阴茎阵发性刺痛，常见于糖尿病周围神经病变或腰椎间盘突出患者。甲钴胺片、加巴喷丁胶囊等神经营养药物可能有效，需配合局部热敷缓解症状。
日常应避免穿紧身裤压迫会阴部，控制辛辣刺激食物摄入，保持规律作息。若疼痛持续超过3天或伴随发热、血尿等症状，须立即至泌尿外科就诊。排尿后注意清洁阴茎冠状沟，性生活前后做好卫生防护，适度运动改善盆腔血液循环。
