如果阴茎的确很短，在正常低线以下，则必须找专科医师就诊。常见有二大类：一是性征发育异常：二是各种类型的尿道下裂和尿道上裂。不仅有阴茎短小，而且有不同程度的阴茎弯曲，会影响性功能和生育。为此，必须进行手术整形治疗。有不少人认为，常态下阴茎的长短是很重要的。其实，常态下阴茎的长短对于性功能的评估没有太大的现实意义，也不能作为评价阴茎功能的主要指标。所以，并不是常态下越长就越好。特别是一些耻骨联合部、会阴部脂肪丰满突出的男性，往往阴茎的发育欠佳，比起正常男性的阴茎会相对短小，而且患者自己目视自己的阴茎困难，更加认为自己阴茎小。
身高与阴茎长短的比例关系应注意身高与阴茎长短无比例关系，并非身体高大者，阴茎必长，身体矮小者则阴茎必短，这一点已获得许多研究者的科学证明。对阴茎偏小者，只要阴茎的长度在正常范围内，发育正常，就不会影响结婚、生育。男子在青春期发育成熟后，生殖器官已发育完全，不会再有变化了，不可能有任何灵丹妙药使阴茎再变大。如果听信谬传，滥用药物，不仅达不到目的，反而浪费钱财、损害健康。
