胰十二指肠联合切除术这样大的手术并发症的发生率也是比较高的，但是并不是指每一台胰十二指肠联合切除术后都要发生并发症。并发症主要包括近期并发症和远期并发症、近期并发症主要是指发生于术后一个月以内的胰瘘、胆瘘、胃肠吻合口瘘、出血感染等等，这感染也包括一些呼吸道感染、腹腔感染、泌尿系感染、伤口感染等等。而其中胰瘘是最为严重的。因为胰瘘所产生的致死率也是非常高的，也有一些因为术中要切除远端胃要打断胃的迷走神经，从而术后25％的患者有可能发生胃瘫，轻度胃瘫、经保守治疗是可以治好的。重度胃瘫治疗的时间也许需要一个月以上了，而胰十二指肠联合切除术远期并发症主要包括一些，如粘连性肠梗阻包括一些肿瘤的复发、转移、包括胰管的梗阻包括胰腺炎等等。
