慢性骨髓炎是急性化脓性骨髓炎的延续。大多数系统性症状消失了。只有当局部引流不畅时，才会出现全身症状。一般症状仅限于局部地区，通常很顽固，难以治愈，甚至几年或几年都无法治愈。临床上，当进入慢性炎症阶段时，会出现局部肿胀、骨增厚、表面粗糙和压痛。如果有窦道，伤口长时间不会愈合，偶尔会有小片死骨排出。
慢性骨髓炎由反复炎症和多窦道引起，对肢体功能和肌肉萎缩有很大影响。如果发生病理性骨折，可能会出现肢体缩短或成角畸形；如果发病部位靠近关节，关节挛缩或僵硬是常见的。x光片可以显示死亡骨和大量密集新骨的形成，有时会有空洞，如战争创伤和弹片。鸡骨髓炎通常有厚而密的骨量，无明显的死骨，骨髓腔消失。
