扁平疣通常无须治疗，部分患者可自行消退。扁平疣的治疗方式主要有物理治疗、药物治疗、免疫调节治疗、中医治疗、手术治疗等。
1、物理治疗液氮冷冻治疗通过低温破坏疣体组织，适用于数量较少的扁平疣。激光治疗利用高能量光束精准汽化疣体，对周围皮肤损伤较小。电灼治疗通过高频电流烧灼疣体，需由专业医生操作避免留疤。
2、药物治疗水杨酸制剂可促进角质剥脱，常用浓度为百分之二十的外用溶液。维A酸乳膏通过调节表皮细胞分化抑制疣体增生。氟尿嘧啶软膏能干扰病毒DNA合成，适用于顽固性疣体，使用期间可能出现局部刺激反应。
3、免疫调节治疗咪喹莫特乳膏通过激活局部免疫反应清除病毒，需隔日夜间使用。干扰素凝胶可增强细胞抗病毒能力，适用于复发性扁平疣。口服转移因子胶囊能系统性调节免疫功能，疗程通常持续三个月。
4、中医治疗火针疗法通过高温针刺破坏疣体基底部，配合拔罐促进气血运行。中药熏洗常用板蓝根、马齿苋等清热解毒药材，每日浸泡患处二十分钟。耳穴贴压选取肺、内分泌等穴位，通过持续刺激调节机体平衡。
5、手术治疗刮除术采用消毒刮匙完整去除疣体，术后需预防感染。切除术适用于巨大疣体或疑似恶变者，需进行病理检查。两种手术均可能遗留轻微疤痕，面部治疗需谨慎选择。
保持规律作息有助于增强免疫力，每日保证七小时睡眠。饮食宜清淡，多食用富含维生素C的柑橘类水果和深色蔬菜。避免搔抓患处防止病毒扩散，接触疣体后及时洗手。穿着透气棉质衣物减少局部摩擦，洗澡时水温不宜过高。若疣体突然增大、出血或颜色改变，应及时至皮肤科就诊评估。
