磁共振检查最大的优点是没有辐射损伤，还有一个优点是软组织分辨率非常高，比CT要高得多，所以很多病变的细节包括边界、内部结构，磁共振看得很清楚。但是磁共振缺点也比较明显，主要有以下几个:1、磁共振尽管没有辐射损伤，但它有一个强大的磁场，这个磁场会导致损伤，所以进磁共振室一定要听从技术员的安排，尽管没有辐射但是危险还是有的。2、磁共振做肺部检查相对来说不合适，所以一般情况下也不用于做肺部检查。3、磁共振检查时间比较长，这也是它的一个缺点。4、少数情况下磁共振是绝对禁忌，比如心脏起搏器的病人是绝对不能做磁共振的，尽管现在少数的心脏起搏器可以做磁共振，但是这一定要确认过，在没有确认的情况下有心脏起搏器肯定是不能做的。5、眼球里有金属异物，眼球里如果有金属异物是绝对不能做的，因为这个金属异物有可能会被强大的磁场直接从眼球里吸出来，这对眼球的二次损伤，是非常严重的。
