软组织肿瘤病理诊断具有相似性。软组织肿瘤的病理常常是对于病理医生来说有很大的挑战性。因为其是形态学，还有免疫组化，有很多重叠的地方。也就是说，不同的肿瘤可能有相似的形态学的表现，以及相似的免疫组化的表型。免疫组化需要判断肿瘤的分化方向，还需要结合临床以及影像学的资料，找到肿瘤发生的具体的部位以及和周围组织的关系。多数情况下良性的肿瘤和周围的关系界限比较清楚，恶性的常常是浸润性的生长或者是压迫性的生长，这对判断良恶性是很有帮助的。此外除了免疫组化在软组织肿瘤当中需要用以外，分子检测在软组织肿瘤诊断方面也越来越重要。比如诊断腹膜后的高分化脂肪肉瘤，常常用MTM2基因是否有扩增来判断。如果是阳性的结果，对于诊断高分化脂肪瘤或者去分化脂肪肉瘤是非常有帮助的。
