双氧水和碘伏的消毒效果各有优势，具体选择需根据伤口类型和消毒需求决定。双氧水适用于清洁污染伤口和厌氧菌感染，碘伏则对细菌、病毒、真菌等病原体均有广谱杀灭作用，且刺激性较小。
双氧水通过氧化作用破坏微生物细胞结构，尤其对深部组织感染或坏死组织较多的伤口效果显著。其产生的气泡可物理清除创面杂质，但可能延缓愈合过程，且对正常组织有一定腐蚀性。碘伏以聚维酮碘为主要成分，能持续释放游离碘破坏病原体蛋白质，适用于浅表创面、手术切口及黏膜消毒。其杀菌作用持久且不易产生耐药性，但对碘过敏者禁用。
双氧水在接触血液或脓液时会迅速分解，需重复使用才能维持效果，可能增加组织损伤风险。碘伏单次使用即可维持较长时间杀菌活性，且不会与有机物质发生剧烈反应。对于儿童或敏感皮肤，碘伏的温和性更具优势；而对于动物咬伤、锈蚀金属污染等特殊伤口，双氧水的强氧化性更有针对性。
日常家庭消毒建议优先选择碘伏，其使用方便且适用范围广。处理较深伤口时可先用双氧水冲洗，再配合碘伏消毒。两种消毒剂均需避光保存，开封后注意有效期。若伤口出现红肿化脓等感染迹象，或消毒后出现皮肤过敏反应，应及时就医处理。
