CT和核磁共振各有优势，需根据检查部位、病情需求等选择。CT更适合急诊排查骨折、出血等急症，核磁共振对软组织、神经系统等显示更清晰。
CT检查速度快，通常几分钟即可完成，适合创伤、脑出血、肺部病变等紧急情况。其利用X射线成像，能清晰显示骨骼结构、钙化灶及急性出血，但对软组织分辨率较低。辐射量虽在安全范围内，但孕妇、儿童需谨慎选择。核磁共振无电离辐射，通过磁场和射频波成像，对脑组织、脊髓、关节软骨、肌肉韧带等细节呈现更优，尤其适合肿瘤早期筛查、神经系统疾病诊断。但检查时间较长，需保持静止15-60分钟，且对体内金属植入物患者有限制。
CT设备普及率高，费用相对较低，适合基层医院开展常规筛查。核磁共振成本较高，对设备和技术要求更严格，多用于复杂病例的精准诊断。两者互补而非替代，例如脑卒中患者可能先做CT排除出血，再通过核磁共振明确梗死范围。临床中医生会综合患者病情、经济条件、检查目的等因素给出个体化建议。
检查前需告知医生过敏史、妊娠状态及体内金属植入情况。CT检查前可能需要禁食，核磁共振需去除所有金属物品。检查后多饮水有助于造影剂代谢，若出现皮疹、呼吸困难等过敏反应需及时就医。日常保持健康生活方式，定期体检，可减少疾病发生概率。
