海蛇具有祛风除湿、活血通络、解毒止痛等功效，其提取物可用于治疗风湿痹痛、跌打损伤、疮疡肿毒等病症。海蛇的药用价值主要来源于其毒液和肌肉组织中的活性成分，但需在专业医师指导下使用，避免中毒风险。
海蛇毒液中含有神经毒素和酶类成分，能抑制炎症介质释放，缓解关节肿胀疼痛。传统医学常用海蛇干泡酒或配伍中药治疗类风湿性关节炎，常与羌活、独活等药材同用。使用海蛇毒素制剂时可能出现局部皮肤过敏，需立即停用。
海蛇肌肉富含精氨酸和牛磺酸，能改善微循环障碍。临床用于治疗腰椎间盘突出引起的坐骨神经痛，可与当归、红花等活血药材配伍。海蛇酶制剂能溶解血栓，但凝血功能障碍者禁用，用药期间需监测凝血功能。
海蛇毒蛋白酶具有抗炎镇痛作用，其镇痛效果是吗啡的20倍且无成瘾性。适用于癌性疼痛和神经痛，需制成注射剂在医疗机构使用。误食海蛇可能引发呕吐、肌肉麻痹等中毒症状，需立即就医。
海蛇毒素能诱导肿瘤细胞凋亡，对肝癌、肺癌细胞有抑制作用。目前处于实验阶段的抗癌肽HSTX-I需静脉给药，可能出现心悸、低血压等不良反应。该疗法尚未纳入临床指南，患者不可自行尝试。
海蛇多肽可刺激巨噬细胞活性，提高机体抗感染能力。东南亚地区用海蛇汤辅助治疗慢性疲劳综合征，但阴虚火旺体质者服用易引发口腔溃疡。建议每周食用不超过200克新鲜海蛇肉，烹调时需彻底加热灭活毒素。
使用海蛇制品应选择正规医疗机构配制的药剂，避免食用野生海蛇或来源不明的产品。孕妇、儿童及肝肾功能不全者禁用海蛇相关制剂，普通人群使用期间忌食生冷油腻食物。出现皮肤瘙痒、呼吸困难等过敏反应时，需立即停药并注射抗蛇毒血清。日常接触海蛇需做好防护，被咬伤后应保持伤口低位，尽快就医注射特异性抗毒血清。
