臭豆腐的地域差异主要体现在制作工艺、发酵方式和风味特点上，不同地区的臭豆腐在口感、气味和食用方式上存在明显区别。
长沙臭豆腐以黑褐色外皮和金黄色内瓤为特征，采用豆豉、冬笋等原料配制卤水发酵，成品外酥里嫩，搭配辣椒酱和蒜汁食用。发酵过程中产生的挥发性硫化物赋予其独特气味，高温油炸后气味减弱而鲜味突出。
绍兴臭豆腐使用苋菜梗浸泡的卤水发酵，呈现青灰色，质地绵软带有霉香。传统采用蒸制方式食用，发酵菌种以毛霉为主，产生的氨基酸使鲜味更醇厚，部分产品会加入黄酒提升风味层次。
南京臭豆腐分为灰白和淡黄两种色泽，使用蔬菜与香辛料复合发酵液浸泡，气味相对温和。常见做法包括油炸和炖煮，发酵时间较短使其保留更多豆香，常与鸭血粉丝汤搭配食用。
台湾臭豆腐经低温长时间发酵，表皮呈浅黄色且布满气孔，具有发酵乳酪般的复合香气。多采用油炸后搭配泡菜食用，部分改良品种会添加水果或茶叶参与发酵以降低刺激性气味。
王致和臭豆腐为腐乳形态，使用豆腐坯接种毛霉后盐渍发酵，质地细腻呈豆青色。直接作为佐餐小食，发酵过程中产生的丙氨酸和谷氨酸使其鲜味集中，部分产品会加入芝麻油调味。
食用臭豆腐需注意选择正规商家产品，避免食用未充分发酵或保存不当的制品。发酵过程中产生的益生菌有助于肠道健康，但高盐油炸制品应控制摄入量。不同地域臭豆腐的营养成分存在差异，绍兴臭豆腐的蛋白质分解更充分，长沙臭豆腐经过高温油炸后脂肪酸比例会发生变化。建议根据个人口味偏好和消化能力选择合适品种，初次尝试者可先从气味较温和的南京臭豆腐开始。
