被锥虫入侵可能引起死亡，但具体风险与锥虫种类、感染阶段及治疗时机有关。锥虫病主要包括美洲锥虫病和非洲锥虫病，前者由克氏锥虫引起，后者由布氏锥虫引起。
美洲锥虫病慢性期可能导致心脏肥大、消化道扩张等严重并发症，未经治疗的患者中约30％会发展为致命性心脏病变。非洲锥虫病若进展至中枢神经系统受累阶段（睡眠病），可出现意识障碍、昏迷，若不及时干预死亡率极高。两种疾病在急性期均可出现发热、淋巴结肿大等非特异性症状，早期规范治疗可显著改善预后。
部分克氏锥虫感染者可能长期处于无症状携带状态，仅通过血液检测发现寄生虫血症。布氏锥虫冈比亚亚型感染后病程可达数年，而罗德西亚亚型进展更快，数周至数月即可危及生命。免疫功能低下者、儿童及孕妇感染后病情恶化风险更高。
预防锥虫病需避免锥蝽或采采蝇叮咬，流行区输血前应进行血液筛查。出现不明原因发热、头痛或心脏症状时应及时就医检测，确诊后需使用硝呋莫司、苯硝唑或喷他脒等特效药物。保持居住环境清洁、使用蚊帐及驱虫剂可有效降低感染风险。
