多数情况下直径小于5毫米的肛乳头瘤无须手术，主要处理方式有局部用药、物理治疗、定期随访观察、手术切除。
肛乳头瘤可能与慢性炎症刺激有关，表现为肛门异物感或排便出血。可遵医嘱使用马应龙麝香痔疮栓、复方角菜酸酯乳膏、普济痔疮栓等药物缓解症状。
较小病灶可采用激光或冷冻治疗，适用于伴有肛门瘙痒或分泌物增多的患者。治疗前需排除感染性病变。
无症状且生长缓慢的乳头瘤可每半年进行肛门指诊和肛门镜检查，监测病灶变化情况。
直径超过5毫米、引起排便困难或反复出血的乳头瘤建议手术，常用术式包括肛乳头瘤电切术、传统切除术。
日常保持肛门清洁干燥，避免久坐久站，饮食注意增加膳食纤维摄入，出现肛门坠胀或出血加重应及时复查。
