病毒性脑炎恢复期通常为2-4周，实际时间受到病毒类型、免疫状态、治疗时机、并发症等因素影响。
1、病毒类型肠道病毒引起者恢复较快，单纯疱疹病毒等重症感染可能延长至数月。早期抗病毒治疗可缩短病程。
2、免疫状态儿童及免疫力低下患者恢复较慢，需监测脑水肿等并发症。静脉免疫球蛋白可能帮助重症患者加速康复。
3、治疗时机发病72小时内使用阿昔洛韦等抗病毒药物效果最佳。延误治疗可能导致脑组织不可逆损伤。
4、并发症合并癫痫或意识障碍者需更长时间恢复。康复期可能出现注意力不集中等后遗症，需神经功能训练。
恢复期应保证充足营养，逐步恢复日常活动，定期复查脑电图评估预后，遗留认知障碍者需专业康复训练。
