体内的益生菌主要有助于维持肠道菌群平衡、增强免疫力、促进营养吸收、抑制有害菌生长。
益生菌通过竞争性抑制有害菌定植，维持肠道微生态平衡，减少腹泻或便秘发生，可配合双歧杆菌三联活菌散等药物辅助治疗。
益生菌能激活肠道免疫细胞分泌免疫球蛋白A，提升黏膜防御能力，对反复呼吸道感染患者可选用枯草杆菌二联活菌颗粒调节。
部分益生菌能分解乳糖产生乳酸，帮助乳糖不耐受者消化乳制品，改善营养吸收障碍时可考虑地衣酵母菌散剂干预。
益生菌代谢产物如细菌素可直接抑制沙门氏菌等致病菌繁殖，针对抗生素相关性腹泻可使用酪酸梭菌活菌胶囊进行拮抗治疗。
日常可通过酸奶、泡菜等发酵食品补充益生菌，但出现严重肠道症状时应及时就医评估菌群状态。
