针刺麻醉存在镇痛效果个体差异大、无法完全消除术中疼痛、可能引发晕针反应、不适用于复杂手术等缺陷。
针刺麻醉对痛觉神经的抑制作用有限，约部分患者术中仍会感到明显疼痛，尤其对内脏牵拉痛控制较差，常需辅助药物镇痛。
仅适用于浅表小手术如拔牙、甲状腺切除等，对开胸开腹等大手术无法提供足够镇痛，且不适用于凝血功能障碍患者。
部分患者因紧张或体质因素出现晕针反应，表现为面色苍白、冷汗、血压下降等症状，需立即停止操作并平卧处理。
需提前进行穴位刺激诱导，麻醉起效时间超过常规药物，术中还需持续行针维持效果，延长手术准备时间。
选择针刺麻醉前应充分评估手术类型及个人耐受性，术中需配备应急药物和设备，术后注意观察针刺部位有无血肿或感染。
