挑选柚子可通过观察外形、按压果皮、掂量重量、闻气味、看果蒂等方法判断。柚子外形匀称、果皮紧实有弹性、重量沉甸甸、散发清香、果蒂新鲜绿润的品质较好。
优质柚子多呈梨形或葫芦形，表皮光滑无凹陷，色泽均匀呈淡黄色或黄绿色。避免选择有明显机械损伤、霉斑或颜色发青的果实。特别要注意柚子的脐部，凹陷过深可能影响果肉发育。
用手指轻按柚子上部，成熟柚子果皮会轻微下陷后回弹，质地紧实有韧性。果皮过硬可能未完全成熟，过软则可能存放过久。按压时注意感受果皮厚度，皮薄肉厚的柚子更佳。
同等大小的柚子，手感越沉说明果肉水分越充足。可将两个相似大小的柚子放在双手比较，选择相对更重的那个。重量过轻可能是果肉干瘪或果皮过厚，这类柚子口感较差。
新鲜柚子靠近果蒂处能闻到清新柑橘香气，气味过淡可能成熟度不足，有发酵酒味或霉味则已变质。剥开少许果皮闻内部气味更准确，优质柚子果肉香气浓郁持久。
新鲜柚子果蒂呈青绿色且与果实连接紧密，干燥发黑或容易脱落的说明采摘时间较长。果蒂周围表皮出现皱缩，表明水分已开始流失。部分品种果蒂带小枝叶也是新鲜度的参考指标。
挑选后的柚子宜存放在阴凉通风处，避免阳光直射。未剥开的完整柚子常温下可保存2-3周，已切开的应用保鲜膜包裹冷藏并尽快食用。食用时可搭配蜂蜜水缓解可能的胃肠刺激，胃肠敏感者建议分次少量食用。若发现果肉变色变味应立即停止食用。
