柠檬姜茶具有促进消化、缓解恶心、增强免疫力、抗氧化、辅助缓解感冒症状等功效。柠檬富含维生素C，生姜含有姜辣素，两者结合可发挥协同作用。
生姜中的姜辣素能刺激胃肠蠕动，帮助分解食物中的脂肪和蛋白质。柠檬中的有机酸可促进胃酸分泌，改善消化不良症状。饭后适量饮用温热的柠檬姜茶，有助于减轻胃部饱胀感。胃肠功能较弱者应避免空腹饮用，以免刺激胃黏膜。
生姜中的活性成分姜烯酚可通过作用于消化系统和中枢神经系统，减轻妊娠呕吐、晕动症等引起的恶心感。柠檬的清新香气能通过嗅觉神经传递至大脑呕吐中枢，产生抑制恶心的效果。术后或化疗后出现恶心症状时，可小口慢饮低浓度柠檬姜茶。
每100克柠檬含22毫克维生素C，能促进白细胞增殖并增强其吞噬能力。生姜中的姜醇具有抗病毒特性，可抑制呼吸道合胞病毒等病原体复制。冬季每日饮用适量柠檬姜茶，配合充足睡眠，有助于降低呼吸道感染概率。
柠檬含有的柠檬多酚和维生素E能中和体内过氧化物，减少自由基对细胞膜的损伤。生姜中的姜黄素类物质可激活超氧化物歧化酶，增强机体抗氧化防御系统。长期适量饮用对延缓皮肤老化、预防动脉粥样硬化有一定帮助。
生姜的发汗解表作用能加速体内寒气排出，缓解风寒感冒初期的畏寒症状。柠檬维生素C可缩短感冒病程，其含有的柠檬苦素具有抗炎效果。出现咽喉肿痛时，用温热柠檬姜茶漱口能减轻黏膜充血，但急性胃肠炎伴发热时应避免饮用。
建议选择新鲜柠檬和生姜现煮现饮，避免高温久煮破坏维生素C。糖尿病患者需控制蜂蜜添加量，胃溃疡急性期患者禁用。日常饮用浓度不宜过高，以200毫升水中加入3片柠檬和2片生姜为宜，连续饮用不超过2周。出现过敏症状如皮肤瘙痒、口腔肿胀时应立即停用。
