鸡蛋、绿叶蔬菜、母乳、辣椒、葡萄等食物不宜用微波炉加热。
带壳鸡蛋在微波炉加热时内部蒸汽无法释放，可能引发爆裂。水煮蛋或煎蛋复热时也可能因局部过热产生爆炸风险。建议将鸡蛋切块后加盖加热，或改用蒸锅等传统方式复热。
菠菜、油菜等富含硝酸盐的蔬菜经微波加热易转化为亚硝酸盐。高温还会破坏其中水溶性维生素。如需加热建议快速焯水或短时清炒，避免微波炉高温长时间处理。
微波加热会导致母乳中免疫球蛋白等活性成分变性，且容易产生局部高温烫伤婴儿口腔。应采用温水浴缓慢复温，使用前需摇晃均匀确保温度一致。
辣椒中的辣椒素受热挥发后可能刺激呼吸道和眼睛。微波加热时密闭空间会加剧这种刺激，开启炉门时可能引发剧烈咳嗽。建议改用烤箱或炒锅进行加热处理。
葡萄等小型水果在微波炉中会产生等离子体放电现象，可能损坏微波炉元件。水果中的糖分集中加热还会形成高温糖浆造成烫伤。切片后短时加热相对安全。
使用微波炉时应注意选择适合的容器，避免使用金属器皿或带有金边的陶瓷制品。加热液体类食物需放置搅拌棒防止暴沸，固体食物应加盖并留出气孔。定期清洁微波炉内壁，防止食物残渣碳化影响加热效率。对于不确定是否适宜微波加热的食物，建议优先选择传统加热方式。
