磨好的豆浆需要煮沸后持续加热5-10分钟以彻底灭活有害物质。生豆浆含有皂苷、胰蛋白酶抑制剂等成分，充分煮沸可避免引发恶心、腹泻等不适。
豆浆在研磨过程中，大豆细胞结构被破坏，释放出的皂苷可能刺激胃肠黏膜，未充分加热时还会残留胰蛋白酶抑制剂，影响蛋白质消化吸收。当豆浆加热至80-90℃时会出现假沸现象，此时需调至中小火继续煮沸，确保温度达到100℃并维持足够时间。使用厚底锅可避免糊底，煮沸过程中需持续搅拌使受热均匀。现磨豆浆建议当天饮用完毕，冷藏保存不超过24小时，复热时仍需煮沸。豆渣富含膳食纤维，可一同煮沸或另作烹饪原料。
饮用豆浆时可搭配谷物提高蛋白质利用率，但肾功能异常者需控制摄入量。若煮沸后出现絮状沉淀属正常现象，过滤后不影响食用。儿童及消化功能较弱人群建议稀释后饮用，避免空腹大量摄入。出现腹胀或过敏症状应立即停用，乳糖不耐受者可用豆浆替代牛奶，但需确保煮沸彻底。
