短膜壳绦虫病的发病机制主要与虫体吸附肠黏膜、掠夺营养及代谢产物刺激有关。短膜壳绦虫感染后，虫体头节吸附于宿主小肠黏膜，导致局部炎症反应，其代谢产物可能引发过敏反应，虫体大量繁殖时还可导致机械性肠梗阻。
短膜壳绦虫头节通过吸盘和钩齿固定于小肠黏膜，造成机械性刺激和黏膜损伤。长期吸附可导致肠黏膜充血水肿，严重时形成浅表溃疡，影响营养吸收功能。患者可能出现间歇性腹痛、腹泻等消化道症状，粪便检查可见虫卵或节片。
成虫以宿主肠内容物为食，大量寄生时会竞争性消耗蛋白质、碳水化合物等营养物质。儿童长期感染可能导致生长发育迟缓、贫血等营养不良表现，部分患者会出现异食癖或维生素B12缺乏相关症状。
虫体代谢释放的抗原物质可诱发宿主过敏反应，表现为荨麻疹、皮肤瘙痒等超敏反应。这些毒素还可能抑制宿主消化酶活性，加重消化不良症状，实验室检查可见嗜酸性粒细胞增多。
当虫体数量过多时，可能缠绕成团阻塞肠腔，引发不完全性肠梗阻。患者会出现阵发性绞痛、呕吐、腹胀等急腹症表现，腹部触诊可触及条索状包块，影像学检查显示肠管扩张。
虫体分泌的免疫调节蛋白可能干扰宿主免疫应答，增加继发其他病原体感染的概率。免疫功能低下者感染后症状更为显著，可能出现持续发热、体重下降等全身反应。
预防短膜壳绦虫病需注意饮食卫生，避免生食或半生食可能被虫卵污染的蔬菜水果，饭前便后规范洗手。感染者应遵医嘱使用吡喹酮片、阿苯达唑片等驱虫药物，治疗期间保持清淡饮食，定期复查粪便虫卵。家庭成员需同步筛查，对患者衣物寝具进行煮沸消毒，切断传播途径。
