豆腐一般可以与大多数蔬菜搭配食用，但少数情况下需避免与高草酸或高鞣酸蔬菜同食过量。豆腐富含优质蛋白和钙质，草酸和鞣酸可能影响钙吸收或导致胃肠不适。
菠菜、苋菜、空心菜等绿叶蔬菜草酸含量较高，与豆腐同食时草酸易与钙结合形成草酸钙，可能降低豆腐中钙的利用率，长期过量食用可能增加肾结石风险。这类蔬菜建议先焯水去除部分草酸后再与豆腐搭配。竹笋、茭白等含草酸较高的蔬菜同理，焯水后可减少影响。苦瓜、芥菜等略带苦味的蔬菜与豆腐同炖时，可能影响豆腐的嫩滑口感，但不会产生有害物质，可根据个人口味调整。
柿子、未成熟的番茄等含鞣酸较多的果蔬与豆腐同食可能产生沉淀，导致消化不良或腹胀。这类组合需严格控制食用量，胃肠功能较弱者更应避免。传统说法中豆腐与蜂蜜、葱的搭配禁忌缺乏科学依据，正常食用不会产生毒性，但蜂蜜高温烹煮可能破坏营养成分，建议豆腐菜肴冷却后再添加蜂蜜调味。
豆腐作为高蛋白食物，建议搭配胡萝卜、木耳、菌菇等富含膳食纤维的蔬菜促进消化吸收。烹饪时注意控制油盐用量，避免油炸豆腐等高热量做法。肾功能异常者需在医生指导下控制豆制品摄入量，痛风急性发作期应限制食用。
