适量食用正规制作的臭豆腐通常无害，但过量或食用劣质产品可能引发胃肠不适或食品安全风险。
臭豆腐作为发酵豆制品，其制作过程依赖毛霉菌等微生物发酵，正规生产会严格控制菌种纯度和卫生条件。发酵产生的蛋白质分解产物赋予独特风味，同时生成少量B族维生素和益生菌，对健康人群的肠道微生态有一定调节作用。选择经过冷链运输、包装完整且在保质期内的产品，高温油炸后食用可进一步降低微生物风险。对于乳糖不耐受或大豆过敏者，需谨慎尝试。
部分小作坊可能使用工业原料加速发酵或添加非法防腐剂，这类产品易残留亚硝酸盐或致病菌。食用后可能出现恶心、腹泻等急性胃肠炎症状，长期摄入可能增加肝肾代谢负担。街边摊贩若重复使用煎炸油，会产生多环芳烃等致癌物。高血压患者需注意臭豆腐通常含盐量较高，可能影响血压控制。
建议选择正规商超购买包装臭豆腐，每周食用不超过2-3次，每次100克以内。食用时可搭配新鲜蔬菜水果，其维生素C有助于阻断亚硝胺形成。出现腹痛、呕吐等症状应及时就医，特殊体质人群建议先进行食物耐受性测试。
