在早期，多数患者一般无症状。损害大小及形状不等，可仅为数个，亦可为多数针头样大的损害。在阴肛部可长成大的肿瘤样物，有压迫感;有恶臭味;有时小的生殖器疱疹可出现阴部痛痒不适，病人可出现尿血和排尿困难;直肠内生殖器疱疹可发生疼痛、便血，而直肠内大的生殖器疱疹则可引起里急后重感。因为生殖器疱疹具有很强传染性，在夫妻双方中或者家庭中如果有一分患有生殖器疱疹那么在检查时则应该做到家人一起检查，因为生殖器疱疹不仅可以通过性接触传播，还可以通过间接接触、性器官摩擦、母婴等多种方式进行治疗传播，有效的避免交叉感染是方式生殖器疱疹长出来的前提。
