含牙囊肿手术后可能出现暂时性神经麻木、创口感染、邻近牙齿损伤、囊肿复发、颌骨结构改变等后遗症。含牙囊肿是牙源性囊肿的一种，手术是主要治疗方式，术后需密切观察恢复情况。
暂时性神经麻木多因手术牵拉或压迫下牙槽神经导致，表现为下唇及颏部皮肤感觉减退或异常，通常3-6个月可逐渐恢复。创口感染与口腔细菌环境相关，可能出现局部红肿、疼痛或渗出液，需加强口腔清洁并使用抗生素控制。邻近牙齿损伤常见于囊肿紧贴牙根时，可能造成牙髓活力测试异常或牙齿松动，需进行牙髓治疗或固定处理。
囊肿复发主要与囊壁残留有关，表现为术后影像学检查发现新发囊性阴影，需二次手术彻底清除。颌骨结构改变多见于大型囊肿术后，可能出现咬合关系紊乱或面部轮廓改变，严重者需植骨修复。少数情况下可能出现病理性骨折，与颌骨广泛破坏相关，需进行颌间固定或骨板内固定。
术后应保持口腔卫生，使用氯己定含漱液漱口，避免辛辣刺激食物。定期复查曲面断层片监测颌骨恢复情况，发现异常及时处理。术后3个月内避免剧烈运动或颌面部外伤，出现持续疼痛、肿胀或感觉异常需立即复诊。营养方面注意补充钙质和维生素D促进骨愈合，可适量食用牛奶、鱼类及深绿色蔬菜。
