食道癌活检存在误诊概率，但临床误诊率较低。活检是诊断食道癌的金标准，其准确性受取材质量、病理医师经验等因素影响。
规范操作的活检误诊主要与取材局限性有关。早期食道癌病变可能呈点状分布，若活检未取到癌变组织，可能得出假阴性结果。黏膜下浸润型食道癌因病灶位于深层，浅表活检也可能漏诊。炎症、溃疡等良性病变在病理学上可能与高分化鳞癌混淆，导致假阳性诊断。现代病理技术已显著提升鉴别能力，联合免疫组化检查可降低误判风险。
极少数情况下可能出现标本混淆或技术失误。标本固定不当导致组织自溶、微小活检标本处理失误，或病理医师经验不足误判罕见病理类型，均可能造成误诊。对于临床高度怀疑但活检阴性的病例，建议重复活检或结合超声内镜、CT等影像学检查综合判断。
选择三级医院进行活检可降低误诊风险。术前避免进食辛辣刺激食物，活检后需禁食2-4小时观察出血情况。若出现持续胸痛、呕血等症状应及时就医。定期胃镜复查有助于早期发现病变，尤其是有Barrett食管、长期反流性食管炎等高危人群。
