对于小儿先天性梅毒的治疗方法有：1.一般疗法 患儿体质衰弱，易患呼吸系或消化系疾病者，应当认真隔离，不接触各种传染病，还应哺喂人乳，补充各种维生素，使其营养充足。必要时可以输血。 2.青霉素疗法 梅毒病原体对青霉素敏感，一般无抗药性，所以早期应用疗效极高，不仅疗程短，对继发性感染也容易控制。其应用指征包括先天梅毒的临床或X线证据，以及未经治疗的母亲显示脐带血的梅毒阳性反应。在治疗前应做脑脊液检查，如结果异常则应用下述疗法：青霉素G水溶液肌注或静脉注射：第1天注射总量宜小，约3～5万U，以免由于杀灭大量螺旋体而释放出异性蛋白质所致的不良反应。自第2天起逐渐增加，直至每天总量12万U为止，疗程共10～15天。 如果脑脊液正常，可肌注节星青霉素G5万U/（kg·次），每周1次，共3次。 无论用何种青霉素，婴儿病例每个疗程总剂量一般为30万U/kg。1～3岁小儿每疗程总量不超过300万U，较大儿童不超过600万U。保证足够的总剂量，是治疗成功的最重要条件。不过在开始治疗时，为了避免发热，皮疹加重及急性溶血性贫血等不良反应，宜自小剂量开始。疗程完毕后，应在2、4、6、9、12月后重复检查血清反应，如治疗较晚则应追踪更久，需要时可重复治疗。但血清反应自阴性回到阳性或自弱阳性转变为强阳性者为数甚少。普通根据临床复发现象可再给青霉素，其剂量应较初次所用者为大。
经过青霉素充分治疗后，先天性梅毒的病状迅速见好，亦无角膜炎或神经系统后遗症。但梅毒血清反应的消失是逐渐的，需要1年左右。至于青霉素对骨骼系统的影响，如于生后最初3个月内施行治疗，可以加速骨骼病变的自愈，尤以骨软骨炎及骨髓炎的病变更迅速见好，对于骨膜炎则影响较小。如果延至3个月以后才治疗，则对骨骼病变的疗效不显著。在治疗过程中，虽骨骼X线影尚未改善，假性瘫痪却很易消失。如果耽误治疗，直到1～2岁时才进行，可能发生间质性角膜炎等晚期特征。如果认真用青霉素治疗，肃清脑脊液中增加的细胞和蛋白质，一般不会发生晚期梅毒的神经症状。 带有外伤及分泌物中查见病原体的患儿，在开始青霉素治疗后，应继续严格隔离24小时，此后即不会找到梅毒螺旋体，也不须隔离。 3.其他药物疗法 如确定对青霉素过敏，可给其他抗生素。在新生儿及婴儿时期一般用红霉素，剂量为15mg/（kg·d），连用12～15天，口服或注射均可。 发生间质性角膜炎的病例，局部用可的松水剂或油剂，每日4～6次，但在用激素之前应排除单纯疱疹的可能性。同时应用阿托品扩大瞳孔。
