肺泡蛋白沉积症多数情况下属于慢性疾病，严重程度因人而异，主要与病变范围、肺功能损害程度、是否合并感染等因素有关。
局限性病变通常症状轻微，表现为轻度活动后气促；弥漫性病变可能导致严重呼吸衰竭，需氧疗支持。
早期肺功能检查可能仅显示弥散功能下降，随着疾病进展可出现限制性通气功能障碍，严重者需机械通气。
继发肺部感染会加重呼吸困难症状，常见病原体包括肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等，需及时抗感染治疗。
对全肺灌洗治疗敏感的患者预后较好，反复灌洗无效者可能发展为肺纤维化，最终需要肺移植。
建议患者定期进行肺功能监测，避免吸烟及接触粉尘，出现明显气促或发热时应及时就医评估。
