盐酸小檗碱片具有抗菌消炎、调节血脂、辅助降血糖、改善肠道功能等功效，主要用于治疗胃肠炎、细菌性痢疾等感染性疾病。
盐酸小檗碱片对多种细菌有抑制作用，包括大肠杆菌、痢疾杆菌等，可用于治疗细菌性胃肠炎。常见伴随症状为腹痛腹泻，可遵医嘱与蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌胶囊联合使用。
该药物能抑制肠道胆固醇吸收，辅助降低血清总胆固醇水平。适用于高脂血症患者，通常表现为头晕乏力，建议配合阿托伐他汀钙片、非诺贝特胶囊等调脂药物使用。
通过延缓碳水化合物分解发挥辅助控糖作用，适合2型糖尿病患者。常见症状为多饮多尿，需在医生指导下与二甲双胍、格列美脲等降糖药联用。
可调节肠道菌群平衡，缓解功能性腹泻或便秘。可能与肠道蠕动异常有关，表现为腹胀肠鸣，可联合枯草杆菌二联活菌颗粒进行治疗。
使用盐酸小檗碱片期间应避免辛辣刺激饮食，出现皮疹等过敏反应需立即停药就医，长期服用需监测肝肾功能。
