咖啡在空腹时、睡前6小时内、服用特定药物期间以及胃肠疾病发作期不宜饮用，主要与胃黏膜刺激、睡眠干扰、药物相互作用和胃肠负担加重有关。
空腹饮用咖啡会刺激胃酸分泌，可能引发胃痛或反酸。建议搭配食物食用，胃肠敏感者可选择低咖啡因饮品。
咖啡因半衰期约5小时，睡前饮用易导致入睡困难。下午3点后建议改用洋甘菊茶等无咖啡因饮品。
咖啡因可能影响左甲状腺素、喹诺酮类抗生素等药物吸收。服用这些药物需间隔2小时以上再饮用咖啡。
胃溃疡、肠易激综合征发作期饮用会加重腹痛腹泻。症状缓解后可逐步尝试低因咖啡，每日不超过200毫升。
咖啡饮用需结合个体耐受度调整，孕妇、高血压患者等特殊人群应咨询医师建议，日常可选择红茶、大麦茶等替代饮品。
