胶原蛋白被人体吸收主要与消化酶分解、氨基酸吸收、肽段转运、肠道健康及个体差异等因素有关。胶原蛋白在胃肠中被分解为小分子肽和氨基酸后，通过特定转运机制进入血液循环，最终参与皮肤、骨骼等组织的合成修复。
胃蛋白酶和胰蛋白酶将胶原蛋白水解为多肽和游离氨基酸。胃酸环境激活胃蛋白酶原转化为胃蛋白酶，其优先切割胶原蛋白中的脯氨酸-甘氨酸键。胰液中的胰蛋白酶和糜蛋白酶进一步将大分子肽段降解为二肽、三肽等小分子物质，为后续吸收创造条件。
游离氨基酸通过肠上皮细胞的钠依赖性中性氨基酸转运体被主动吸收。其中脯氨酸、甘氨酸和羟脯氨酸等胶原蛋白特征性氨基酸，通过PAT1和B0AT1等转运蛋白进入细胞。这些氨基酸随后经门静脉系统进入肝脏代谢，部分直接进入体循环。
二肽三肽通过PEPT1转运体完整吸收入血。该转运体对含脯氨酸的胶原蛋白肽段具有较高亲和力，能使部分活性肽逃避肠道完全水解。这些生物活性肽可刺激成纤维细胞增殖，促进内源性胶原蛋白合成。
肠道黏膜完整性和菌群平衡影响吸收效率。肠上皮细胞紧密连接蛋白缺陷会导致未完全消化的胶原蛋白大分子漏入血液引发过敏。双歧杆菌等益生菌可分解胶原蛋白肽为更小分子，同时维持肠道低炎症状态有利于营养吸收。
年龄增长导致消化酶分泌减少和肠道吸收面积下降。胃酸缺乏者胶原蛋白分解效率降低，而运动后肌肉微损伤会优先调用吸收的氨基酸用于修复。遗传因素如PEPT1转运体基因多态性也会导致不同个体对胶原蛋白肽的吸收率存在差异。
日常可通过补充维生素C增强脯氨酸羟化酶活性，选择水解胶原蛋白肽粉提高吸收率，避免与高纤维食物同食减少吸附。规律运动能促进胶原蛋白在肌腱和皮肤中的定向沉积，而长期吸烟或高糖饮食会加速胶原蛋白降解。出现慢性腹泻或营养不良症状时，建议就医评估是否存在吸收障碍性疾病。
