会厌囊肿多数情况下不会自行消失，通常需要通过手术切除治疗。会厌囊肿的处理方式主要有观察随访、药物治疗、手术切除、激光治疗。
1、观察随访
体积较小的无症状会厌囊肿可暂时观察，定期复查喉镜监测变化。
2、药物治疗
合并感染时可使用抗生素如阿莫西林、头孢克肟、左氧氟沙星控制炎症，但无法消除囊肿本身。
3、手术切除
全麻下经口支撑喉镜行囊肿切除术是根治方法，适用于直径超过1厘米或有吞咽梗阻症状者。
4、激光治疗
二氧化碳激光气化适用于表浅小囊肿，具有出血少、恢复快的优势。
术后需保持口腔清洁，避免辛辣刺激饮食，定期复查防止复发，出现呼吸或吞咽困难应及时就医。
