全飞秒激光手术治近视眼多数情况下安全，但可能存在干眼症、夜间眩光、角膜混浊、视力回退等后遗症。
1、干眼症手术可能暂时影响角膜神经调节，导致泪液分泌减少。可通过人工泪液缓解，常用药物包括玻璃酸钠滴眼液、羧甲基纤维素钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液。
2、夜间眩光角膜切削后光学区边缘折射变化可能导致夜间视物光晕。多数患者3-6个月逐渐适应，严重者可考虑佩戴防眩光眼镜。
3、角膜混浊极少数患者因个体愈合反应出现角膜基质层轻微雾状浑浊。若影响视力需使用糖皮质激素滴眼液如氟米龙、氯替泼诺干预。
4、视力回退高度近视患者术后可能因眼轴持续增长出现度数反弹。需定期复查，必要时可进行二次增效手术或佩戴低度数眼镜矫正。
术后严格遵医嘱使用眼药水，避免揉眼及游泳，定期复查可显著降低后遗症发生概率。
