阴茎根部疼痛可能由外伤、前列腺炎、精索静脉曲张、尿道结石等原因引起，需根据具体病因采取针对性治疗。
1、外伤阴茎根部受到撞击或挤压可能导致局部软组织损伤，表现为肿胀疼痛。建议停止剧烈运动，48小时内冷敷处理，可遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片、云南白药气雾剂等药物缓解症状。
2、前列腺炎细菌感染或久坐可能诱发前列腺充血炎症，常伴有尿频尿急症状。需进行前列腺液检查，可遵医嘱服用左氧氟沙星片、盐酸坦索罗辛缓释胶囊、癃闭舒胶囊等药物，配合温水坐浴改善循环。
3、精索静脉曲张静脉瓣功能不全导致血液淤积，可能引起阴囊坠胀并放射至阴茎根部。轻度可通过阴囊托带缓解，重度需行精索静脉高位结扎术，可遵医嘱使用迈之灵片、地奥司明片、七叶皂苷钠片等药物。
4、尿道结石结石移动可能刺激尿道黏膜，引发尖锐疼痛并向会阴部放射。建议多饮水促进排石，较大结石需体外冲击波碎石，可遵医嘱使用消石胶囊、尿石通丸、肾石通颗粒等药物。
出现持续不缓解的阴茎根部疼痛应及时就诊泌尿外科，避免剧烈运动，保持会阴部清洁干燥，每日饮水量建议超过2000毫升。
