精子发黄伴随小便疼痛可能由生理性因素、泌尿系统感染、前列腺炎、性传播疾病等原因引起，需结合具体症状及检查明确诊断。
1、生理因素长时间未排精可能导致精液浓缩发黄，伴随轻微排尿不适。建议保持规律排精频率，每日饮水超过2000毫升，观察症状是否缓解。
2、泌尿系统感染细菌性尿道炎或膀胱炎可能导致尿道黏膜充血，表现为排尿灼痛伴精液颜色改变。可能与卫生习惯不良、饮水不足有关，通常伴随尿频尿急。可遵医嘱使用左氧氟沙星、头孢克肟或磷霉素等抗生素。
3、前列腺炎慢性前列腺炎可引起精液成分改变，出现黄色脓性分泌物。可能与久坐、饮酒有关，常伴会阴胀痛。需进行前列腺液检查，可选用坦索罗辛、塞来昔布或阿奇霉素等药物。
4、性传播疾病淋球菌或衣原体感染时尿道分泌物混入精液，导致颜色异常并伴随排尿刺痛。多有不洁性接触史，需实验室确诊。治疗需根据病原体选择头孢曲松、多西环素或阿奇霉素等药物。
出现持续症状时应避免性生活，及时泌尿外科就诊检查精液常规与尿培养，治疗期间禁止饮酒并保持会阴部清洁干燥。
