肠炎可以吃抗生素、肠益生菌、肠黏膜保护剂、抗分泌治疗剂。肠炎要根据医院的经验性选择抗菌药物，然后根据粪便细菌培养和药敏实验结果进行调节。大肠埃希菌、工厂曲线菌、耶尔森菌、鼠伤寒沙门菌引起的感染经常使用抗革兰阴性杆菌和大环内地方性抗生素。金黄色葡萄球菌肠炎、可膜性肠炎、真菌性肠炎应立即停用原来使用的抗生素，根据症状可选择苯甲西林钠、万古霉素、利福平、甲硝唑或抗真菌治疗。双歧杆菌、产梭菌、地衣芽孢杆菌等肠内益生菌有助于恢复肠内正常菌群的生态平衡，抑制病原体的定植和侵袭，控制腹泻。蒙脱石分散及其他肠黏膜保护剂可以吸附病原体及毒素，维持肠细胞的吸收和分泌功能，与肠粘液糖蛋白相互作用，提高屏障功能，防止病原微生物攻击。内啡肽酶抑制剂少先卡度曲可以通过强化内源性内啡肽来抑制长寿电解质的分泌。避免使用泻药，抑制肠胃动力，会增加细菌和毒素的吸收。肠炎发生水电解质平衡障碍时，应给予口服补充盐和相应的电解质。使用药物时最好在医生指导下使用。
