尿结石形成的原因有很多，目前形成机制比较赞同的是过饱和结晶这个机制。影响的因素主要包括，水分摄入，任何破坏水的数量与损失平衡的因素，如出汗过多，饮水量过少，都会造成尿中钙和盐过饱和，增加造成结石的形成。饮食和营养饮食的成分和结构，对尿结石的形成具有很重要的影响。地理环境和气候要实际的发病率有明显的地区性差异。热带亚热带地区的尿结石发病率较高，考虑与周围环境温度，湿度等因素有关。尿路任何部位的狭窄梗阻都可造成尿液主流，导致晶体在该部位的形成，继发尿路感染，更有利于结石的形成。有些结石与遗传病有关。
