巴氏腺摘除术通常不属于大手术，属于门诊或日间手术范畴。巴氏腺囊肿或脓肿反复发作、药物治疗无效、严重影响生活质量时可能需手术干预，手术方式主要有巴氏腺造口术、巴氏腺切除术两种。
巴氏腺造口术创伤较小，通过切开引流并建立永久性开口，保留腺体功能，术后恢复较快。巴氏腺切除术需完整切除腺体，适用于反复感染或疑似病变的情况，手术范围相对较大但仍在会阴局部操作。两种术式均采用局部麻醉或骶管麻醉，手术时间通常在半小时至一小时之间，术后可能出现短暂疼痛、肿胀或出血，多数患者一周内可恢复日常活动。
特殊情况下如腺体位置异常、合并严重感染或解剖结构复杂时，手术难度可能增加。肥胖患者、凝血功能障碍者或存在未控制的糖尿病等基础疾病时，术后感染风险略高，需加强围手术期管理。极少数情况下可能发生术后血肿、伤口愈合不良或腺体再生需二次手术。
术后需保持会阴清洁干燥，避免剧烈运动及性生活至少两周，穿着宽松棉质内衣减少摩擦。饮食宜清淡富含优质蛋白和维生素，促进伤口愈合。若出现发热、持续出血或剧烈疼痛应及时复诊。定期随访有助于评估手术效果及预防复发。
