无创亲子鉴定结果通常是准确的，准确率可达到较高水平。无创亲子鉴定主要通过采集孕妇外周血中的胎儿游离DNA进行分析，具有无创、安全、便捷等优势。影响结果准确性的因素主要有检测机构资质、孕周大小、孕妇体重、双胎妊娠、实验室技术水平等。
正规检测机构采用高通量测序技术，对母血中胎儿DNA片段进行数百万次测序分析，通过生物信息学比对计算亲子关系概率。孕周过小可能导致胎儿DNA浓度不足，一般建议孕10周后进行检测。孕妇体重过大可能稀释胎儿DNA比例，影响检测灵敏度。双胎妊娠需特殊标记区分两个胎儿的DNA信息。
极少数情况下可能出现假阴性结果，如孕妇患有某些血液疾病导致胎儿DNA比例异常低，或近期接受过输血治疗。染色体嵌合体现象也可能干扰结果判断。部分特殊亲缘关系鉴定如叔侄关系，准确率可能略低于标准亲子鉴定。
选择具有临床检验资质的正规机构进行检测，按要求采集送检样本，可最大限度保证结果可靠性。若对结果存在疑问，可通过羊水穿刺等有创方式进行复核。检测前后应进行专业遗传咨询，正确理解报告中的概率数值含义。保持合理心理预期，避免因检测结果引发家庭矛盾。
