会厌囊肿和会厌癌的主要差别在于病变性质，会厌囊肿是良性囊性病变，会厌癌是恶性上皮细胞肿瘤。两者在发病机制、症状表现、检查手段及治疗方式上均有显著差异，主要区别包括病理类型、生长速度、浸润倾向、转移概率及预后效果。
会厌囊肿由黏液腺导管阻塞形成，囊壁为上皮细胞包裹液体，属于非肿瘤性病变。会厌癌多为鳞状细胞癌，病理活检可见异型细胞核分裂象，伴随周围组织浸润性生长。囊肿生长缓慢且局限，癌症呈侵袭性增殖。
会厌囊肿早期多无症状，增大后可出现咽喉异物感或轻度吞咽不适，极少影响呼吸。会厌癌早期即有持续性咽痛、声嘶，进展期出现吞咽困难、痰中带血，晚期可能因气道阻塞导致呼吸困难。癌症疼痛呈进行性加重。
CT检查中囊肿表现为边界清晰的低密度影，无周围组织浸润。会厌癌显示为不规则软组织肿块，增强扫描呈不均匀强化，常伴有颈部淋巴结肿大。喉镜下囊肿表面光滑呈淡蓝色，癌变组织多呈菜花状或溃疡性增生。
会厌囊肿较小且无症状时可观察，较大者行喉镜下微创切除即可治愈。会厌癌需综合治疗，早期采用激光或手术切除，中晚期需联合放疗、化疗及靶向治疗。癌症术后需定期复查防止复发转移。
会厌囊肿切除后无复发风险，不影响生存质量。会厌癌预后与分期相关，早期五年生存率较高，晚期易发生肺、骨等远处转移。癌症患者需长期随访监测肿瘤标志物及影像学变化。
发现咽喉部异常症状应及时就诊喉科，通过电子喉镜、增强CT或病理活检明确诊断。会厌囊肿患者术后避免辛辣食物刺激，定期复查喉镜。会厌癌患者需严格戒烟酒，治疗期间加强营养支持，配合吞咽康复训练改善生活质量。两类疾病均需避免过度用嗓和呼吸道感染。
