生殖器局部感染后，如会阴部、阴唇、阴蒂、阴道黏膜及宫颈出现成簇的红色小丘疹，迅速变成小疱，后形成糜烂或浅溃疡，有时可发生在肛门周围。患者常感局部轻度瘙痒、刺痛，并可有发热、头痛等全身不适及局部淋巴结肿大经过7~10天，病灶处可以结痂，待痂皮脱落而自愈。
该病容易反复发作。孕妇感染后，病毒通过胎盘可以引起胎儿的感染，而导致流产、早产、死胎及胎儿先天畸形。当胎儿经产道分娩时，新生儿发生感染的机会约40%，还有报道可高达到95%。分娩
后，新生儿很快会出现症状，病死率高达50%;部分存活者还往往留有神经系统后遗症。
妊娠足月伴有生殖器疱疹感染的孕妇，应行剖官产分娩。该病以预防为主，讲究性卫生，不与患病者接触。