肾结石的尿常规可分为一般检查与特殊检查，一般检查主要为尿常规检查，它包括pH、相对密度（比重）、红细胞、脓细胞、蛋白、糖、晶体等。肾结石患者的尿常规一般检查可有3种异常：1）尿石患者的尿中可以发现血尿或肉眼血尿、晶体尿等，但15%的患者没有血尿。2）尿pH值的高低常提示某种类型的结石：磷酸钙、碳酸磷灰石结石患者的尿pH值常高于7.0；而尿酸、胱氨酸和草酸钙结石患者的尿pH值常小于5.5。3）在非感染性结石，可有轻度的脓尿肾结石尿常规特殊检查有3项①尿结晶检查：应留取新鲜尿液。如看见苯样胱氨酸结晶提示可能有胱氨酸结石；如尿中发现尿酸结晶，常提示尿酸结石可能；发现信封样的晶体就可能是二水草酸钙结石；棺材盖样晶体则为磷酸镁铵晶体；在疑有磺胺类药物结石的患者的尿中会发现磺胺结晶。
②尿细菌培养：菌落>105/ml者为阳性。
药敏试验则可了解最有效的抗生素。尿培养如为产生尿素的细菌，则有感染结石存在的可能。③24h尿的化验：须正确收集24h的尿液，尿液计量要准确。化验的内容包括：24h尿钙、磷、镁、枸橼酸、尿酸、草酸、胱氨酸等。