起源于脑结构性病变的部分性发作癫痫，其预后取决于病因是否得到根除。这类癫痫病患者虽然对药物治疗具有抵抗性，但经过3～5年治疗之后其缓解率可达40%～50%，特别是只有一种发作形式的比具有多种发作形式的患者预后好，其缓解率可达65%以上。儿童良性局灶性癫痫是各类型癫痫中预后最好的，85%的患者在青春期之前终止发作，80%以上在14岁之前缓解。有1%～2%的患者以后可以演变成大发作，极少转变为其他类型。复杂部分性发作癫痫患者停药后复发率较高，多数专家建议长期服药控制。部分性发作适宜手术治疗，手术常能控制其发作。