中医治疗甲状腺炎需辨证论治，发病初期使用疏风清热类中药治疗；病情中期，可应用清泻肝胆湿热中药治疗；后期可应用健脾补肾中药治疗。
1、疏风清热类中药
发病初期有恶寒、发热及颈肩疼痛等症状，中医辨证为风热犯肺所致。所以可适当应用具有疏风清热效果中药治疗。
2、清泻肝胆湿热中药
中期会出现颈前疼痛、耳部疼痛、口苦咽干及情绪急躁易怒的症状，中医辨证为肝胆火盛。可使用能够清泻肝胆湿热的中药或中成药治疗。
3、健脾补肾中药
甲状腺炎后期会出现神疲乏力、倦怠及胃寒等症状，中医辨证为脾肾阳虚，需应用健脾补肾中药治疗。