小阴茎通过药物、手术等方法予以治疗，可以治好小阴茎。治疗目的是恢复阴茎正常长度，满足患者正常生理功能，进而达到改善生育能力。
1、药物治疗药物治疗又被称内分泌治疗，主要通过口服、肌肉注射、皮下注射、局部应用等方式促使患者促进腺激素分泌逐渐趋于正常，改善性功能减退、纠正性腺功能异常等症状。药物治疗应用较为广泛，一般以多种方法联合治疗为主。2、手术治疗手术治疗主要适合于青春期后仍然存在阴茎短小者，主要方法为阴茎延长手术，通过阴茎再造成形术、阴茎假体放置、外阴整形术等方法促使阴茎短小从外观上得以改善，正常功能不受影响。手术治疗预后良好，但是具体手术效果还要根据患者实际病情及选择诊治医院而定。