生殖器疱疹的病原体为单纯疱疹病毒(HSV)。根据血清学、流行病学的研究,HSV可分为HSV-l型及HSV-2型。生殖器疱疹是由于与黏膜或皮肤表面有单纯疱疹病毒释放的人发生性接触而致病的。约90%的患者属HSV-2型感染,通常由性交传染,孕妇患此病也可通过产道传染给胎儿或新生儿;约10%属HSV-l型感染,由性交或口交感染。
HSV属于疱疹病毒科,是直径为150~200毫米大小的DNA病毒,呈球形,它包含有一个75纳米直径的双链DNA核心(基因组),其外有一蛋白质衣壳(直径约100纳米)所包绕,衣壳为20面体,由162个病毒衣壳组成。外有含脂质的包膜。