水杨酸祛痘可能出现皮肤刺激、干燥脱屑、过敏反应等副作用，合理使用可降低风险。水杨酸主要通过溶解角质、抑制皮脂分泌发挥祛痘作用，但浓度过高或使用不当可能损伤皮肤屏障。
水杨酸浓度超过2%时易引发皮肤泛红、刺痛或灼热感，尤其是敏感肌或初次使用者。部分人群使用后会出现局部脱屑现象，这与水杨酸促进角质剥脱的特性有关。少数情况下可能诱发接触性皮炎，表现为瘙痒、水肿等过敏症状。不当使用可能破坏皮肤微生态平衡，导致继发感染。长期高频使用可能使皮肤产生耐受性，降低祛痘效果。
使用水杨酸祛痘产品前应进行耳后测试，从低浓度开始逐步建立耐受。避免与维A酸类、果酸等其他角质剥脱剂叠加使用。出现持续红斑或脱皮时应暂停使用并加强保湿修复。孕妇、哺乳期女性及皮肤破损者须谨慎使用。建议配合舒缓类护肤品如含神经酰胺、泛醇的成分，以减轻潜在刺激。