阻生智齿拔除过程中通常会有轻微疼痛，但多数情况下可通过麻醉有效控制。术后可能出现短暂胀痛，一般1-3天可缓解。
拔牙前会进行局部麻醉，注射时可能有短暂刺痛感，麻醉生效后手术区域会失去知觉。术中患者可能感受到器械压力或震动，但不会出现剧烈疼痛。对于复杂阻生齿或骨埋伏较深的情况，手术时间可能延长至30-60分钟，此时麻醉效果可能减弱，医生会根据需要追加麻醉剂。术后麻醉消退后，创口会出现钝痛或跳痛感，疼痛程度与创伤范围相关，横向阻生齿拔除的疼痛感通常比垂直阻生齿更明显。
极少数情况下可能出现干槽症，表现为术后3-5天突发剧烈疼痛伴腐臭味，需立即就医处理。糖尿病患者或长期服用抗凝药物者可能因愈合延迟导致疼痛期延长至5-7天。对麻醉药物过敏者可能出现麻醉不全，术中疼痛感增强，这类情况需提前告知医生调整方案。
术后24小时内可冰敷减轻肿胀，48小时后改用热敷促进血液循环。避免用吸管饮水或用力漱口，防止血凝块脱落。饮食选择温凉流质食物，避免辛辣刺激。若疼痛持续超过3天或伴随发热、脓性分泌物，应及时复诊排除感染。遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、洛索洛芬钠片等镇痛药物，但不可超过推荐疗程。